LOVE Exe mengikuti kisah Lyn, seorang pengembang aplikasi yang dikenal cerdas, cepat berpikir, namun cenderung menutup diri dari urusan hati. Ia terbiasa memecahkan masalah melalui logika, hingga tidak menyadari bahwa kehidupannya mulai kehilangan warna. Segalanya berubah ketika ia bertemu dengan Achi, fotografer muda yang menjalani hidup dengan prinsip spontan dan jujur pada perasaan. Pertemuan keduanya tidak dimulai dengan kesan manis—lebih seperti benturan antara dua dunia dengan cara pandang yang bertolak belakang. Namun, hubungan mereka justru berkembang ketika Lyn tanpa sengaja mengunduh versi beta aplikasi “LOVE Exe”, program kecerdasan buatan yang ia buat sendiri untuk membantu orang lain mengenali kecocokan pasangan. Aplikasi itu mulai memberikan data, prediksi, dan analisis yang terus menuntun Lyn—terkadang terlalu jauh—dalam membaca perasaannya terhadap Achi.